Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHADO15335 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHADO15335 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHADO15335 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHADO15335 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHADO15335 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHADO15335 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHADO15335 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHADO15335 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHADO15335 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHADO15335 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHADO15335 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHADO15335 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHADO15335 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHADO15335 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHADO15335 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHADO15335 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHADO15335 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHADO15335 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHADO15335 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHADO15335 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHADO15335 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHADO15335 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHADO15335 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHADO15335 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHADO15335 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHADO15335 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHADO15335 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHADO15335 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHADO15335 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHADO15335 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHADO15335 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHADO15335 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHADO15335 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHADO15335 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHADO15335 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHADO15335 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHADO15335 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHADO15335 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHADO15335 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHADO15335 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHADO15335 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHADO15335 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHADO15335 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHADO15335 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHADO15335 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHADO15335 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHADO15335 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHADO15335 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHADO15335 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHADO15335 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHADO15335 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHADO15335 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHADO15335 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHADO15335 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHADO15335 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHADO15335 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHADO15335 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHADO15335 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHADO15335 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHADO15335 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHADO15335 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHADO15335 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHADO15335 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHADO15335 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHADO15335 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHADO15335 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHADO15335 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHADO15335 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHADO15335 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHADO15335 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHADO15335 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHADO15335 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHADO15335 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHADO15335 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHADO15335 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHADO15335 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHADO15335 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHADO15335 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHADO15335 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHADO15335 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHADO15335 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHADO15335 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHADO15335 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHADO15335 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHADO15335 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHADO15335 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHADO15335 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms