Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM9SF1O15321 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms