Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNPHO15079 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNPHO15079 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNPHO15079 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNPHO15079 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNPHO15079 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNPHO15079 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNPHO15079 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNPHO15079 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNPHO15079 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNPHO15079 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNPHO15079 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNPHO15079 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNPHO15079 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNPHO15079 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNPHO15079 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNPHO15079 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNPHO15079 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNPHO15079 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNPHO15079 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNPHO15079 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNPHO15079 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNPHO15079 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNPHO15079 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNPHO15079 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNPHO15079 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNPHO15079 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNPHO15079 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNPHO15079 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNPHO15079 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNPHO15079 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNPHO15079 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNPHO15079 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNPHO15079 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNPHO15079 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNPHO15079 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNPHO15079 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNPHO15079 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNPHO15079 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNPHO15079 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNPHO15079 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNPHO15079 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNPHO15079 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNPHO15079 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNPHO15079 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNPHO15079 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNPHO15079 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNPHO15079 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNPHO15079 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNPHO15079 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNPHO15079 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNPHO15079 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNPHO15079 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNPHO15079 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNPHO15079 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNPHO15079 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNPHO15079 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNPHO15079 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNPHO15079 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNPHO15079 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNPHO15079 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNPHO15079 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNPHO15079 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNPHO15079 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNPHO15079 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms