Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLGNO14967 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLGNO14967 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLGNO14967 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLGNO14967 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLGNO14967 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLGNO14967 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLGNO14967 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLGNO14967 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLGNO14967 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLGNO14967 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLGNO14967 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLGNO14967 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLGNO14967 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLGNO14967 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLGNO14967 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLGNO14967 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLGNO14967 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLGNO14967 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLGNO14967 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLGNO14967 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLGNO14967 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLGNO14967 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLGNO14967 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLGNO14967 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLGNO14967 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLGNO14967 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLGNO14967 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLGNO14967 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLGNO14967 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLGNO14967 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLGNO14967 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLGNO14967 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLGNO14967 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLGNO14967 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLGNO14967 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLGNO14967 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLGNO14967 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLGNO14967 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLGNO14967 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLGNO14967 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLGNO14967 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLGNO14967 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLGNO14967 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLGNO14967 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLGNO14967 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLGNO14967 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLGNO14967 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLGNO14967 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLGNO14967 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLGNO14967 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLGNO14967 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLGNO14967 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLGNO14967 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLGNO14967 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLGNO14967 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLGNO14967 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLGNO14967 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLGNO14967 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLGNO14967 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLGNO14967 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLGNO14967 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLGNO14967 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLGNO14967 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLGNO14967 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLGNO14967 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLGNO14967 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLGNO14967 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms