Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
WNT9AO14904 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT9AO14904 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WNT9AO14904 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT9AO14904 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT9AO14904 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT9AO14904 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT9AO14904 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT9AO14904 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT9AO14904 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms