Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VCYO14598 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VCYO14598 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VCYO14598 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VCYO14598 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VCYO14598 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VCYO14598 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VCYO14598 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VCYO14598 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VCYO14598 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VCYO14598 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VCYO14598 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VCYO14598 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VCYO14598 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VCYO14598 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VCYO14598 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VCYO14598 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VCYO14598 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms