Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
SOCS3O14543 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOCS3O14543 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms