Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRPO00591 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRPO00591 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRPO00591 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRPO00591 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRPO00591 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRPO00591 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRPO00591 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRPO00591 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRPO00591 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRPO00591 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRPO00591 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRPO00591 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRPO00591 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRPO00591 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRPO00591 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRPO00591 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRPO00591 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRPO00591 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRPO00591 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRPO00591 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRPO00591 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRPO00591 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRPO00591 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRPO00591 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRPO00591 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRPO00591 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRPO00591 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRPO00591 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRPO00591 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRPO00591 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRPO00591 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRPO00591 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRPO00591 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRPO00591 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRPO00591 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRPO00591 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRPO00591 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRPO00591 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRPO00591 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRPO00591 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRPO00591 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRPO00591 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRPO00591 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRPO00591 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRPO00591 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRPO00591 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRPO00591 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRPO00591 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRPO00591 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRPO00591 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRPO00591 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRPO00591 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRPO00591 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRPO00591 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRPO00591 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRPO00591 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRPO00591 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRPO00591 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRPO00591 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRPO00591 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRPO00591 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRPO00591 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRPO00591 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRPO00591 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRPO00591 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms