Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN5O00501 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms