Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
O00370 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
O00370 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
O00370 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
O00370 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
O00370 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
O00370 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
O00370 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
O00370 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
O00370 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
O00370 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
O00370 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
O00370 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
O00370 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
O00370 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
O00370 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
O00370 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
O00370 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
O00370 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
O00370 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
O00370 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
O00370 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
O00370 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
O00370 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
O00370 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
O00370 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
O00370 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
O00370 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
O00370 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
O00370 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
O00370 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
O00370 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
O00370 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
O00370 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
O00370 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
O00370 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
O00370 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
O00370 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
O00370 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
O00370 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
O00370 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
O00370 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
O00370 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
O00370 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
O00370 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
O00370 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
O00370 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
O00370 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
O00370 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
O00370 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
O00370 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
O00370 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms