Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC01387J3KSC0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC01387J3KSC0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC01387J3KSC0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC01387J3KSC0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC01387J3KSC0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC01387J3KSC0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC01387J3KSC0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC01387J3KSC0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01387J3KSC0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms