Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms