Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms