Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
E9PCH4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
E9PCH4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
E9PCH4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
E9PCH4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
E9PCH4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
E9PCH4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
E9PCH4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
E9PCH4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
E9PCH4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
E9PCH4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
E9PCH4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
E9PCH4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
E9PCH4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
E9PCH4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
E9PCH4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
E9PCH4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
E9PCH4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
E9PCH4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
E9PCH4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
E9PCH4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
E9PCH4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
E9PCH4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
E9PCH4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
E9PCH4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
E9PCH4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
E9PCH4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
E9PCH4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
E9PCH4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
E9PCH4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
E9PCH4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
E9PCH4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
E9PCH4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
E9PCH4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
E9PCH4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
E9PCH4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
E9PCH4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
E9PCH4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
E9PCH4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
E9PCH4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
E9PCH4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
E9PCH4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
E9PCH4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
E9PCH4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
E9PCH4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
E9PCH4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
E9PCH4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
E9PCH4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
E9PCH4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
E9PCH4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
E9PCH4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
E9PCH4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
E9PCH4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
E9PCH4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
E9PCH4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
E9PCH4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
E9PCH4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
E9PCH4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
E9PCH4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
E9PCH4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
E9PCH4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
E9PCH4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
E9PCH4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
E9PCH4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
E9PCH4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
E9PCH4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
E9PCH4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
E9PCH4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
E9PCH4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
E9PCH4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
E9PCH4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
E9PCH4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
E9PCH4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
E9PCH4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
E9PCH4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
E9PCH4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
E9PCH4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
E9PCH4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
E9PCH4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
E9PCH4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
E9PCH4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
E9PCH4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
E9PCH4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
E9PCH4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
E9PCH4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
E9PCH4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
E9PCH4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
E9PCH4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
E9PCH4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
E9PCH4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
E9PCH4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
E9PCH4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
E9PCH4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
E9PCH4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
E9PCH4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
E9PCH4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
E9PCH4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
E9PCH4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
E9PCH4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
E9PCH4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms