Protein–RNA interactions for Protein: E5RHQ5

NPIPB11, Nuclear pore complex-interacting protein family member B11, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11E5RHQ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPIPB11E5RHQ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NPIPB11E5RHQ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms