Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF879B4DU55 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms