Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK3BL1B0FP48 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK3BL1B0FP48 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms