Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP27XA6NNY8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms