Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L1PA6NM43 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L1PA6NM43 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L1PA6NM43 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L1PA6NM43 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L1PA6NM43 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L1PA6NM43 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L1PA6NM43 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L1PA6NM43 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L1PA6NM43 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT8L1PA6NM43 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms