Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85CA6NKD9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms