Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC69A6NI79 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC69A6NI79 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms