Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HELTA6NFD8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms