Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP17L4A6NCW7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L4A6NCW7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L4A6NCW7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms