Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms