Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPDC1A2A3K4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms