Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRGMA1A4Y4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms