Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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