Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms