Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP164Q9UPV0 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms