Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms