Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFDQ9GZP0 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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