Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZYG11BQ9C0D3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms