Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP1Q9C000 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms