Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms