Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms