Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms