Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSEN34Q9BSV6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms