Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FYCO1Q9BQS8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms