Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAP3Q96P50 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms