Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms