Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHFRQ96EP1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHFRQ96EP1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHFRQ96EP1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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