Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT35Q92764 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms