Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms