Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms