Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms