Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms