Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms