Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms