Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms