Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDZK1Q5T2W1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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